不同碳水化合物對正常人腸道菌群體外模擬效果的比較研究

為了比較不同碳水化合物對正常人腸道菌群體外模擬效果的影響，找出適合腸道菌群體外模擬的條件，研究腸道微生物體外制備方法，范彬, 尹業(yè)師, 孫剛, 等采集3名正常志愿者的糞便樣品，利用以淀粉為主要碳源的培養基VI和以淀粉＋多糖為主要碳源的培養基XP，在體外模擬發(fā)酵模型中對其菌群結構進(jìn)行模擬培養。通過(guò)提取發(fā)酵液細菌基因組DNA，運用PCR-變性梯度凝膠電泳(PCR-DGGE)和16S rRNA基因高通量測序來(lái)評價(jià)模擬系統的穩定性和模擬效果，通過(guò)測定發(fā)酵液短鏈脂肪酸含量來(lái)推斷細菌代謝情況。

 

結果顯示，體外發(fā)酵模型連續運行8 d后，3名志愿者的發(fā)酵液細菌PCR-DGGE條帶一致，不同培養基存在特異的細菌條帶。細菌16S rRNA基因高通量測序結果表明，3名志愿者的糞便樣品主要由4個(gè)細菌門(mén)組成，分別是擬桿菌門(mén)、厚壁菌門(mén)、變形菌門(mén)和放線(xiàn)菌門(mén)。在考慮細菌百分含量的情況下，VI培養基對3名志愿者腸道菌群的模擬相似性是0.847、0.825、0.968，XP培養基為0.927、0.926、0.836。當不考慮細菌百分含量，只考慮細菌種類(lèi)時(shí)，VI培養基對3名志愿者腸道菌群的模擬相似性是0.553、0.580、0.623，XP培養基為0.617、0.520、0.574。VI和XP培養基模擬效果存在個(gè)體差異，VI培養基對志愿者3菌群的模擬效果更好，XP培養基對志愿者1、2菌群的模擬效果更好。VI和XP培養基均能較好地模擬擬桿菌和毛螺旋菌屬細菌的生長(cháng)，但VI和XP培養基中也存在各自特異生長(cháng)的細菌。在發(fā)酵罐內檢測到短鏈脂肪酸的含量是15～35 mmol/L，產(chǎn)生多的是丁酸和丙酸。

發(fā)酵系統可用于腸道細菌的模擬培養，不同碳水化合物對腸道細菌的體外模擬效果有不同影響，能體外模擬培養出相同的細菌，也有在各培養基中特異性生長(cháng)的細菌，但對3名志愿者腸道細菌模擬相似性均在80%以上。

 

特點(diǎn)

1.內控對照已加在預混液中，無(wú)需另外配置，使用便捷。

2.高特異性，一次檢測即可涵蓋所有常見(jiàn)易感染細胞的支原體物種（包括歐洲藥典規定的9種支原體）。與細菌和真核DNA無(wú)交叉反應。

3.高靈敏度，50個(gè)基因組DNA/每個(gè)反應。

4.有相應配套的支原體

基因組DNA和細菌基因組DNA，便于特異性驗證。

5.有相應配套的支原體定量標準品，便于后定量檢測。