PCR Clean™分子實(shí)驗是中常備的實(shí)驗試劑,可有效地降解大多數表面上(輕質(zhì)金屬或有色金屬除外)的擴增子,質(zhì)?;蚧蚪MDNA和RNA。該產(chǎn)品還能有效地去除DNA酶和RNA酶。
同源重組(HR)缺陷與DNA重排和細胞遺傳畸變有關(guān)。矛盾的是,與hr缺陷型癌癥相關(guān)的DNA重排類(lèi)型對染色體結構的影響微乎其微。
近日,為了解決這一明顯的矛盾,研究人員結合了46例BRCA1-或brca2突變型乳腺癌的數千個(gè)具有深連鎖閱讀WGS的腫瘤的短讀全基因組測序(WGS)圖譜的基因組圖譜分析。
相關(guān)研究發(fā)表在《Nature》上,文章標題為:“Long-molecule scars of backup DNA repair in BRCA1- and BRCA2-deficient cancers"。
這些數據揭示了一類(lèi)富含hr缺陷的重排,稱(chēng)為互易對。鏈讀WGS顯示,具有相同重排取向的互反對產(chǎn)生了兩種不同的染色體結果之一,只能通過(guò)長(cháng)分子數據來(lái)區分。一個(gè)(順式)結果對應于一個(gè)小片段的復制和粘貼到一個(gè)遙遠的位點(diǎn),第二個(gè)(反式)結果是一個(gè)準平衡的易位或多兆堿基反轉,在每個(gè)節點(diǎn)上都有大量(10 kb)的重復。我們提出了一個(gè)獨立于hr的復制-重啟修復機制來(lái)解釋互惠對結果的全部范圍。鏈接閱讀WGS還發(fā)現單鏈退火是人類(lèi)癌癥中BRCA2缺乏特異性的修復途徑。將這些特征整合到分類(lèi)器中可以提高BRCA1-和brca2缺陷基因組之間的區分。
總之,該研究的數據揭示了在hr缺陷細胞中,BRCA1或BRCA2缺乏癥的重排類(lèi)型是細胞遺傳畸變的來(lái)源。