單細胞基因組學(xué)和調控網(wǎng)絡(luò )取得新進(jìn)展，支原體祛除噴霧助力科研

單細胞基因組學(xué)是一個(gè)精密的科研學(xué)科，每一個(gè)單獨的細胞都彌足珍貴，包含著(zhù)多樣的遺傳信息，是打開(kāi)生命科學(xué)一把鑰匙。在進(jìn)行單細胞基因組學(xué)的實(shí)驗室中，確保實(shí)驗環(huán)境的純凈、避免細胞污染十分重要。德國MB公司生產(chǎn)的Mycoplasma Off，高效清除實(shí)驗環(huán)境中的支原體、細菌等微生物污染

單細胞基因組學(xué)提供了一種強大的方法來(lái)了解變異如何影響基因表達，特別是在人類(lèi)大腦中眾多細胞類(lèi)型中。此外，它可能會(huì )改善我們對大腦相關(guān)特征的調節機制的理解。然而，需要具有廣泛腦表型的群體規模隊列來(lái)推斷變體之間的關(guān)鍵關(guān)聯(lián)，并在單細胞規模上開(kāi)發(fā)調節模型。

近日，科研人員為了解決這個(gè)問(wèn)題，對受實(shí)驗者進(jìn)行了許多單細胞實(shí)驗[單核RNA測序(snRNA-seq)、snATAC-seq (ATAC，轉座酶可及染色質(zhì)測定)和snMultiome +基因分型]和前額葉皮層樣本的計算分析。

相關(guān)研究成果發(fā)表在《Science》上，文章標題為：“Single-cell genomics and regulatory networks for 388 human brains"?？蒲腥藛T使用單核RNA測序 (snRNA-seq)、單核ATAC-seq測序及單核Multiome測序，并結合基因分型和計算分析，對含超過(guò)280萬(wàn)個(gè)單細胞核在內的388份人腦前額葉皮層樣本進(jìn)行了深度測序，并結合深度學(xué)習模型、eQTL (表達數量性狀位點(diǎn))，構建了細胞類(lèi)型特異性的基因調控和細胞間通訊網(wǎng)絡(luò )，揭示了不同細胞類(lèi)型在老齡化和神經(jīng)精神疾病中的特定改變。

該項研究的人類(lèi)大腦的人口規模單細胞資源，可以幫助促進(jìn)神經(jīng)精神疾病的精確醫學(xué)方法，特別是通過(guò)優(yōu)先考慮與細胞類(lèi)型相關(guān)的后續基因和藥物靶點(diǎn)。