PCRdi檢出限芻議
更新時(shí)間:2020-11-17 | 點(diǎn)擊率:873
現在,PCR試劑盒常用于各種檢測。其中di檢出限是PCR試劑盒一個(gè)重要的參數。PCRdi檢出限就是所能檢測到的靶標的di值。di檢出限的確定應通過(guò)定量標準品來(lái)完成。定量標準品一般是經(jīng)過(guò)嚴格標定拷貝數的陽(yáng)性DNA,梯度稀釋后進(jìn)行一系列的檢測,每個(gè)梯度做8個(gè)復孔,終確定條帶能否觀(guān)測到或確定Ct值。
示例. PCR定量標準品(支原體)(Minerva Biolabs)
接著(zhù)可用Reed-Muench公式計算方法的檢測限(LOD50),lgLOD50=距離比例×稀釋對數質(zhì)檢的差+高于50%檢出率的稀釋度的對數。距離比例=(高于50%檢出率的百分數-50%)/(高于50%檢出率的百分數-低于50%檢出率的百分數)。也可使用Excel軟件在回歸分析中,自動(dòng)計算LOD值(Data>Data Analysis>Regression,選中X,Y值)
PCRdi檢出限相當于方法的靈敏度,它與DNA模板的質(zhì)量(包括是否有雜質(zhì))、整個(gè)PCR反應體系的性能優(yōu)化(包括反應緩沖液、酶的功能、引物序列、引物濃度)、PCR程序條件的設定都有關(guān)系。有人采用巢式PCR,的確使得方法的靈敏度更高,但同時(shí)也增加了反應的復雜性和反應時(shí)間。
總之,PCR具有足夠低的檢測限,才能保證不會(huì )發(fā)生漏檢。因此,在方法學(xué)意義上,di檢測限應受到足夠的重視。
參考文獻:
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