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新研究助力微生物組學(xué)的發(fā)展

更新時(shí)間:2020-12-24  |  點(diǎn)擊率:539

所有多細胞生物體內都有大量微生物定居,并且從一開(kāi)始就伴隨著(zhù)宿主一起進(jìn)化。天然微生物組,即體內和體內生存的全部細菌,病毒和真菌等,對于宿主至關(guān)重要:例如促進(jìn)營(yíng)養的吸收以及抵御病原體。

在近一項研究中,來(lái)自基爾大學(xué)的研究團隊與來(lái)自加州大學(xué)伯克利分校和休斯敦貝勒醫學(xué)院的專(zhuān)家一起,為微生物組研究開(kāi)發(fā)了一種新型的改進(jìn)模型系統,即所謂的“秀麗隱桿線(xiàn)蟲(chóng)微生物組”。資源”(CeMbio)。它基于代表線(xiàn)蟲(chóng)微生物組天然組成的12種細菌。該模型將支持在各種研究中進(jìn)行更現實(shí)的微生物組研究。由Hinrich Schulenburg教授領(lǐng)導的進(jìn)化生態(tài)學(xué)和遺傳學(xué)小組和Christoph Kaleta教授領(lǐng)導的醫學(xué)系統生物學(xué)小組的基爾大學(xué)研究團隊近在科學(xué)雜志《G3: Genes Genomes Genetics》雜志中介紹了CeMbio資源及其主要特征。

基于基爾大學(xué)研究人員的先前工作,即*確定了線(xiàn)蟲(chóng)秀麗隱桿線(xiàn)蟲(chóng)的天然細菌群落,使研究者們能夠研究天然微生物組對線(xiàn)蟲(chóng)的生活功能和適應性的影響。然后將當時(shí)得到完整鑒定的線(xiàn)蟲(chóng)微生物組的組成范圍縮小到十二種代表性細菌,之后將它們用于線(xiàn)蟲(chóng)的定殖實(shí)驗。 “我們將這些細菌分別以純培養物和混合培養物形式轉移到無(wú)菌蠕蟲(chóng)中,然后觀(guān)察它們的生長(cháng)”。 “通過(guò)這種方式,我們能夠表征單個(gè)細菌在蠕蟲(chóng)腸道中定殖的能力以及在自然宿主環(huán)境中不同細菌之間的相互關(guān)系,” Dirksen繼續說(shuō)道。

在工作的第二部分中,科學(xué)家利用了微生物組中存在的所有生物的全基因組序列來(lái)重建細菌的代謝網(wǎng)絡(luò )和代謝能力。因此,使用生物信息學(xué)方法,他們能夠預測宿主和微生物組之間可以交換哪些代謝產(chǎn)物??偟膩?lái)說(shuō),他們?yōu)榫€(xiàn)蟲(chóng)的宿主細菌相互作用的詳細研究創(chuàng )造了一個(gè)現實(shí)的微生物組模型的基礎。

借助CeMbio模型,基爾研究人員現在提供的資源可供*線(xiàn)蟲(chóng)研究界的研究人員公開(kāi)訪(fǎng)問(wèn)。除了可以在實(shí)驗室條件下輕松培養的細菌菌株之外,這還包括其*公開(kāi)的遺傳信息以及代謝網(wǎng)絡(luò )的完整模型。該資源和生成的數據庫現在為研究界提供了一個(gè)新穎的工具包,可用于研究線(xiàn)蟲(chóng)生物學(xué)與自然微生物組相互作用時(shí)從生長(cháng)到發(fā)育等各個(gè)方面。

此外,基爾研究人員希望該新工具作為微生物組研究的模型系統??傊?,CeMbio為*的科學(xué)家提供了一種新穎的資源,可以在自然環(huán)境中研究線(xiàn)蟲(chóng)模型。因此,這項工作為增進(jìn)對微生物組影響其宿主生物健康和疾病的機理的整體理解做出了重要貢獻。

胎牛血清,是由胎牛血漿去除纖維蛋白而形成的一種很復雜的混合物,含有各種血漿蛋白、多肽、脂肪、碳水化合物、生長(cháng)因子、激素、無(wú)機物等,其組成成份大部分已知,但還有一部分尚不清楚,這些物質(zhì)對促進(jìn)細胞生長(cháng)或抑制生長(cháng)活性是達到生理平衡的。其中不含細胞、纖維蛋白和凝血因子。

儲存條件

-20°C凍存。

胎牛血清*解凍后,應按單次習慣用量分裝,分裝后的血清仍-20°C凍存。

若置于4°C的血清,應在一周內用完。

為保證細胞培養的效果,血清和培養基的配置,應遵循“現用現配”原則。配好的培養液,應于一周內用完。

血清避免反復凍融,避免在4°C或更高溫度儲存過(guò)久,否則會(huì )破壞血清中有效活性成分,影響血清品質(zhì)。

 

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