qPCR技術(shù)是分子生物實(shí)驗中,常見(jiàn)的一種幾首手段。使用Quantitative Real Time PCR擴增裝置即qPCR儀,通過(guò)不同的化學(xué)原理和數學(xué)原理,在PCR過(guò)程中實(shí)時(shí)監測核酸擴增產(chǎn)物的技術(shù)。qPCR實(shí)現了通過(guò)Ct值和標準曲線(xiàn)的分析對起始模板進(jìn)行定量分析。
qPCR的熒光標記方法分為以添加熒光基團核酸探針為主的熒光探針?lè )?,以綠色染料為主的熒光染料嵌合法。
利用不同化學(xué)原理設計的qPCR實(shí)驗,
實(shí)驗結果可能會(huì )產(chǎn)生不小的差距!
本期內容,我們一起來(lái)聊聊這兩種常見(jiàn)的qPCR熒光標記方法有何不同,幫助大家選擇更符合自身實(shí)驗需求的方法。
熒光探針?lè )?/strong>
簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō),應用該原理的熒光探針,是由熒光基團+DNA寡核苷酸+淬滅基團構成。
探針由5’端標記有熒光報告基團、目標基因特異性結合的寡核苷酸序列以及3’端標記有淬滅基團以及與組成。
自然狀態(tài)下,探針完整,熒光報告基團發(fā)射的熒光信號被淬滅基團吸收,儀器不會(huì )檢測到熒光信號。
當存在目標序列時(shí),目標DNA變性解鏈,熒光探針特異性結合到目標基因處。引物也結合在目標基因上,Taq酶又名DNA聚合酶,能將核苷酸添加到引物中,引物開(kāi)始延伸。
Taq酶還具有5’-3’核酸外切酶活性。當引物延伸至探針結合處,可將探針水解,使熒光報告基團和淬滅基團分離,進(jìn)而被qPCR儀檢測到熒光信號,熒光信號的強度與擴增得到的DNA的濃度成正比。
熒光信號被儀器檢測并采集得到“擴增曲線(xiàn)",通過(guò)熒光信號的強度反映出體系中雙鏈DNA的濃度。
熒光探針有許多不同種類(lèi),以應對不同的實(shí)驗需求,該方法特異性高,已經(jīng)被廣泛地應用于基因檢測、病原體和病毒檢測、疾病耐藥基因篩查等領(lǐng)域。
德國MB支原體檢測試劑盒
Venor®Gem qEP
應用熒光探針?lè )▽χгwDNA進(jìn)行檢測,準確率高,使用方便。
熒光染料嵌合法
該方法用到一種非特異性雙鏈DNA熒光染料,被激發(fā)后,顯示為綠色熒光。
該染料以一種非特異性方式,與雙鏈DNA(dsDNA)雙螺旋小溝區域相結合。游離的染料熒光信號微弱,在進(jìn)行qPCR擴增生成dsDNA時(shí),染料逐漸與dsDNA結合,熒光信號被很大程度放大,熒光信號的強度與擴增得到的dsDNA的濃度成正比。
熒光信號被儀器檢測并采集得到“擴增曲線(xiàn)",通過(guò)熒光信號的強度反映出體系中dsDNA的濃度。
德國MB支原體qPCR檢測試劑盒,應用熒光探針?lè )ㄔ?,對支原體DNA進(jìn)行檢測,具有特異性更強、靈敏度更高、可重復性更佳的特點(diǎn)。
支原體檢測方面,通過(guò)歐洲藥典和日本藥典方法學(xué)檢驗。