培養細胞時(shí),要避免細菌污染。如果存在細菌污染,則培養液一般會(huì )渾濁變黃,對細胞生長(cháng)影響明顯,細胞大多在24小時(shí)死亡。在以細胞大規模培養為基礎的生物藥產(chǎn)業(yè)中,也需要進(jìn)行無(wú)菌檢查。傳統無(wú)菌檢查是采用TSA或TSB培養基培養的方法,一般需要培養14天,觀(guān)察是否有菌落生長(cháng)或溶液渾濁。
現介紹一種通過(guò)PCR進(jìn)行無(wú)菌檢查的方法,當然該方法也是用于研究。即采用德國MB的細菌檢測試劑盒(Onar Bacteria Detection Kit)。它作為PCR試劑盒,針對的是細菌高度保守的16S rRNA序列,陽(yáng)性產(chǎn)物片段大小為467 bp,可跑膠后在紫外燈下觀(guān)察。另包含一個(gè)內控對照,用于檢測PCR反應是否正常,該內控對照條帶為140 bp。
需要注意的是,樣品在檢測前,應在95 °C做熱滅活 5分鐘,之后每個(gè)PCR反應是加5ul。另外,細胞培養液中應不含抗生素,細胞應在不含抗生素的培養基中培養一代,因為抗生素會(huì )使細菌水平保持在檢測限以下(2.4×10的3次方/ml)。另外,檢測時(shí)應做復孔。整個(gè)反應體系為25ul。
該試劑盒可檢測的細菌包括:假單胞菌,放線(xiàn)菌,大腸埃希氏菌,沙雷氏菌,卟啉單胞菌,梭菌,葡萄球菌,鏈球菌,乳桿菌,微球菌,芽孢桿菌,克雷伯菌,沙門(mén)氏菌,腸球菌,分枝桿菌,軍團菌,葡萄球菌,消化鏈球菌。它不檢測真菌、病毒和真核細胞DNA。
典型結果如下:
總之,早期篩查細胞培養時(shí)是否有細菌污染,可以及時(shí)采取措施,而PCR方法更為靈敏、快速和穩定,可以根據實(shí)際情況酌情使用。
圖. 內控對照顯示PCR反應正常,樣本中無(wú)PCR抑制成分。460bp左右存在目的條帶,提示存在細菌污染。